真空冷凍干燥機在干燥進程中需要一起完結熱量和質量(濕分)的傳遞，確保物料外表濕分蒸汽分壓(濃度)高于外部空間中的濕分蒸汽分壓，確保熱源溫度高于物料溫度。熱量從高溫熱源以各種方式傳遞給濕物料，使物料外表濕分汽化并逸散到外部空間，從而在物料外表和內部呈現濕含量的不同。內部濕分向外表分散并汽化，使物料濕含量不斷下降，逐漸完結物料全體的干燥。物料的干燥速率取決于外表汽化速率和內部濕分的分散速率。
 

　　與其它干燥方法一樣，要維持升華干燥的不斷進行，滿足兩個基本條件，即熱量的不斷供給和生成蒸汽的不斷排除。在開始階段，如果物料溫度相對較高，升華所需要的潛熱可取自物料本身的顯熱。但隨著升華的進行，物料溫度很快就降到與干燥室蒸汽分壓相平衡的溫度，此時，若沒有外界供熱，升華干燥便停止進行。在外界供熱的情況下，升華所生成的蒸汽如果不及時排除，蒸汽分壓就會升高，物料溫度也隨之升高，當達到物料的凍結點時，物料中的冰晶就會融化，也就無法進行了。
 

　　真空冷凍干燥機的程序是這樣的：在凍干之前，把需要凍干的產品分裝在合適的容器內，一般是玻瓶或安瓶，裝量要均勻，蒸發表面盡量大而厚度盡量薄些；然后放入與凍干箱尺寸相適應的金屬盤內。裝箱之前，先將凍干箱進行空箱降溫，然后將產品放入凍干箱內進行預凍，抽真空之前要根據降溫速度提前使冷凝器工作，抽真空時冷凝器應達到-40℃左右的溫度，待真空度達到一定數值后(通常應達到100uHg以上的真空度)，即可對箱內產品進行加熱。一般加熱分兩步進行，步加溫不使產品的溫度超過共熔點的溫度；待產品內水份基本干完后進行第二步加溫，這時可迅速地使產品上升的規定的高溫度。在高溫度保持數小時后，即可結束凍干。與產品在每瓶內的裝量，總裝量，玻璃容器的形狀、規格，產品的種類，凍干曲線及機器的性能等等有關。
 

　　凍干結束后，要放干燥無菌的空氣進入干燥箱，然后盡快地凍干進行加塞封口，以防重新吸收空氣中的水份。
 

　　在凍干過程中，把產品和板層的溫度、冷凝器溫度和真空度對照時間劃成曲線，叫做凍干曲線。一般以溫度為縱坐標，時間為橫坐標。凍干不同的產品采用不同的凍干曲線。同一產品使用不同的凍干曲線時，產品的質量也不相同，凍干曲線還與凍干機的性能有關。因此不同的產品，不同的凍干機應用不同的凍干曲線。